Theo quy định tại Thông tư số 56/2017/TT-BYT ngày 29/12/2017 của Bộ
Y tế nguyên tắc cấp Giấy chứng nhận nghỉ việc hưởng BHXH được hướng dẫn
như sau: Việc cấp Giấy chứng nhận nghỉ việc hưởng BHXH phải do cơ sở khám
bệnh, chữa bệnh đã được cấp giấy phép hoạt động cấp; căn cứ tình trạng sức khỏe của nguời bệnh, cơ sở khám chữa bệnh sẽ chỉ định số ngày nghỉ ngoại trú phù hợp với tình trạng sức khỏe và hướng dẫn chuyên môn của Bộ Y tế; ngày cấp Giấy chứng nhận nghỉ việc hưởng BHXH phải trùng với thời gian người lao động đi khám, chữa bệnh tại cơ sở khám bệnh, chữa bệnh (trừ trường hợp cấp lại Giấy chứng nhận nghỉ việc hưởng BHXH). Đối với các trường hợp Giấy chứng nhận nghỉ việc hưởng BHXH cấp không đúng theo quy tại Thông tư số 56/2017/TT-BYT cơ quan BHXH không đủ căn cứ để tiếp nhận giải quyết. BHXH Việt Nam là cơ quan tổ chức thực hiện chính sách BHXH, không có thẩm quyền quy định về thủ tục hồ sơ giải quyết hưởng chế độ BHXH đối với người lao động. Việc các cơ sở khám bệnh, chữa bệnh tại BHXH một số tỉnh, thành phố không thống nhất trong cấp Giấy chứng nhận nghỉ việc hưởng BHXH đối với người lao động mắc Covid-19 gây khó khăn cho cơ quan BHXH trong quá trình giải quyết hưởng chế độ BHXH.

Ngày 02/3/2022, Bộ Y tế đã có Tờ trình Thủ tướng Chính phủ số 279/TTr-BYT về việc giải quyết cấp Giấy chứng nhận nghỉ việc hưởng BHXH đối với người lao động mắc COVID-19 và đang được cơ quan có thẩm quyền xem xét, giải quyết. Cơ quan BHXH sẽ tổ chức tiếp nhận và giải quyết chế độ ốm đau đối với người lao động theo quy định mới ngay sau khi cấp có thẩm quyền ban hành quy định sửa đổi, bổ sung về hồ sơ làm căn cứ giải quyết hưởng chế độ ốm đau đối với người lao động bị mắc Covid-19.